Omkring 2 000 fullständigt sekvenserade mitokondriegenom finns tillgängliga från NCBI RefSeq-databasen tillsammans med manuellt kuraterade annotationer av deras proteinkodande gener, rRNA och tRNA. Denna annoteringsinformation, som har samlats under två decennier, har erhållits med hjälp av en rad olika beräkningsverktyg och annoteringsstrategier. Trots alla ansträngningar för manuell kuratering är den fortfarande behäftad med felaktiga tilldelningar av läsriktningar, felaktiga gennamn och saknade eller falskt positiva annotationer, särskilt när det gäller RNA-gener. Sammantaget orsakar detta betydande problem för helautomatiska pipelines som syftar till att använda dessa data på ett heltäckande sätt för studier av djurens fylogenetik och den molekylära utvecklingen av mitogenomerna. MITOS-pipeline är utformad för att beräkna en konsekvent de novo-annotation av mitogenomsekvenserna. Vi visar att resultaten från MITOS matchar RefSeq och MitoZoa när det gäller annotationstäckning och kvalitet. Samtidigt undviker vi bias, inkonsekvenser i nomenklaturen och skrivfel som härrör från manuella kureringsstrategier. MITOS-pipeline är tillgänglig online på http://mitos.bioinf.uni-leipzig.de.

.