I bioinformatik är miRBase en biologisk databas som fungerar som ett arkiv för mikroRNA-sekvenser och kommentarer. I september 2010 innehöll den information om 15 172 mikroRNA. Detta antal har ökat till 38 589 i mars 2018. MiRBase-registret tillhandahåller ett centraliserat system för att tilldela mikroRNA-gener nya namn.
microRNA database
University of Manchester
Ana Kozomara
Kozomara & al. (2011)
www.mirbase.org
miRBase växte fram ur den resurs för mikroRNA-register som inrättades av Sam Griffiths-Jones 2003.
Enligt Ana Kozomara och Sam Griffiths-Jones har miRBase fem mål:
- Att tillhandahålla ett konsekvent namngivningssystem för mikroRNA
- Att tillhandahålla en central plats som samlar alla kända mikroRNA-sekvenser
- Att tillhandahålla information som kan läsas av människor och datorer om varje mikroRNA. microRNA
- För att tillhandahålla primära bevis för varje microRNA
- För att samla och länka till information om microRNA:s mål
MiRBase innehåller miRNA:er som tillhör olika arter som hör till Alveolata, Chromalveolata, Metazoa, Mycetozoa, Viridiplantae och Virus. För Viridiplantae finns i version 21 (2014) data tillgängliga för 73 arter. Detta inkluderar 4800 unika mogna miRNAs och 8480 prekursorsekvenser.
Den aktuella versionen av MiRBase är release 22 (mars 2018).