Johnny Sauter började tävla 1996, efter att ha uppfyllt ett löfte han gav sin far, short-track racerföraren Jim Sauter, om att avsluta gymnasiet innan han började sin karriär. Den infödde Necedah, Wisconsin, gick med i American Speed Association (ASA) 1998. Under 2001 utsågs Sauter, under ledning av teamchefen Joe Shear, Jr. till ASA-mästare och årets rookie med ett rekord på 10 segrar.
Samma år gjorde han sin första start i det som nu kallas NASCAR Xfinity Series. Han delade med sig av åket under säsongen 2003 och vann Xfinity Owners Championship. Sauter gjorde också sin debut i NASCAR Cup Series och sin debut i NASCAR Camping World Truck Series det året.
Sauter gick över till Trucks på heltid 2009 och tog sin första seger på Las Vegas Motor Speedway det året. År 2016 tog Sauter sitt första förarmästerskap i serien efter en säsong som innehöll tre segrar, en pole, 12 topp femor och karriärens högsta 19 topp tio placeringar.
Sauter fortsatte att förtjäna sin plats i rekordböckerna 2017 och 2018, vann ytterligare 10 lopp och säkrade fyra platser i mästerskapet under båda säsongerna; han blev den enda föraren i serien som deltog i alla tre mästerskapsstriderna sedan Chase-formatet infördes
Som en riktig riktig racerförare fortsätter Sauter att tävla på lokal nivå i sin hemstat Wisconsin, där han är bosatt tillsammans med sin fru Cortney och deras fyra barn.