Nanoscale Molecular Dynamics (NAMD, anterior Not Another Molecular Dynamics Program) este un software de calculator pentru simularea dinamicii moleculare, scris folosind modelul de programare paralelă Charm++. Se remarcă prin eficiența sa paralelă și este adesea utilizat pentru a simula sisteme mari (milioane de atomi). A fost dezvoltat prin colaborarea Grupului de Biofizică Teoretică și Computațională (TCB) și a Laboratorului de Programare Paralelă (PPL) de la Universitatea Illinois din Urbana-Champaign.

Nanoscale Molecular Dynamics

Dezvoltator(i)

Universitatea Illinois din Urbana-Champaign: Theoretical and Computational Biophysics Group (TCB), Parallel Programming Laboratory (PPL)

Lansare inițială

1995; acum 26 de ani

Lansare stabilă

Repository

Scris în

C++

Sistem de operare

Cross-platform: Windows, Linux, macOS, Unix

Platforma

x86, x86-64

Disponibil în

Engleză

Tip

Simulare de dinamică moleculară

Licență

Proprietate, freeware pentru utilizare necomercială

Website

www.ks.uiuc.edu/Research/namd

A fost introdus în 1995 de Nelson et al. ca un cod de dinamică moleculară paralelă care permite simularea interactivă prin conectarea la codul de vizualizare VMD. NAMD s-a maturizat de atunci, adăugând multe caracteristici și scalând dincolo de 500.000 de nuclee de procesor.

NAMD are o interfață cu pachetele de chimie cuantică ORCA și MOPAC, precum și o interfață scriptată cu multe alte pachete cuantice. Împreună cu Visual Molecular Dynamics (VMD) și QwikMD, interfața NAMD oferă acces la simulări hibride QM/MM într-o suită integrată, cuprinzătoare, personalizabilă și ușor de utilizat.

NAMD este disponibil ca freeware pentru utilizare necomercială de către persoane fizice, instituții academice și corporații pentru utilizări comerciale interne.

.