În bioinformatică, miRBase este o bază de date biologice care acționează ca o arhivă de secvențe de microARN și adnotări. În septembrie 2010, aceasta conținea informații despre 15.172 de microARN-uri. Acest număr a crescut la 38 589 până în martie 2018. Registrul miRBase oferă un sistem centralizat pentru atribuirea de noi denumiri genelor de microARN.

miRBase

Logo-ul miRBase.png

Content

Description

microRNA database

Contact

Research center

Universitatea din Manchester

Autori

Ana Kozomara

Citare primară

Kozomara & al. (2011)

Data publicării

Acces

Site-ul web

www.mirbase.org

miRBase s-a dezvoltat din resursa de înregistrare a microARN-urilor înființată de Sam Griffiths-Jones în 2003.

Potrivit Anei Kozomara și lui Sam Griffiths-Jones, miRBase are cinci obiective:

  1. Să ofere un sistem de denumire coerent pentru microARN-uri
  2. Să ofere un loc central care să colecteze toate secvențele cunoscute de microARN-uri
  3. Să ofere informații lizibile de către om și calculator pentru fiecare microARN
  4. Pentru a furniza dovezi primare pentru fiecare microARN
  5. Pentru a agrega și a crea legături cu informații despre țintele microARN

MiRBase conține miARN-uri aparținând diferitelor specii aparținând Alveolata, Chromalveolata, Metazoa, Mycetozoa, Viridiplantae și Virusuri. Pentru Viridiplantae, în versiunea 21 (2014) sunt disponibile date pentru 73 de specii. Aceasta include 4800 de miARN-uri mature unice și 8480 de secvențe precursoare.

Versiunea actuală a MiRBase este versiunea 22 (martie 2018).

.

Lasă un răspuns

Adresa ta de email nu va fi publicată.