Johnny Sauter a început să concureze în 1996, după ce și-a îndeplinit o promisiune pe care i-a făcut-o tatălui său, pilotul de curse pe pistă scurtă Jim Sauter, de a termina liceul înainte de a-și începe cariera. Nativul din Necedah, Wisconsin, s-a alăturat Asociației Americane de Viteză (ASA) în 1998. În 2001, condus de șeful de echipaj Joe Shear, Jr, Sauter a fost numit campion ASA și începător al anului, cu un record de 10 victorii.
În același an a luat primul start în ceea ce este cunoscut acum sub numele de NASCAR Xfinity Series. El a împărțit cursa pentru sezonul 2003, câștigând Campionatul proprietarilor Xfinity. Sauter și-a făcut, de asemenea, debutul în NASCAR Cup Series și debutul în NASCAR Camping World Truck Series în acel an.
Sauter a trecut la Camioane cu normă întreagă în 2009 și a obținut prima sa victorie la Las Vegas Motor Speedway în acel an. În 2016, Sauter și-a adjudecat primul său campionat de piloți din serie în urma unui sezon care a inclus trei victorii, un pole position, 12 clasări în top cinci și 19 clasări în top zece, un record al carierei.
Sauter a continuat să își câștige locul în cărțile de recorduri în 2017 și 2018, câștigând alte 10 curse și asigurându-și patru locuri în campionat în ambele sezoane; devenind singurul pilot din serie care a apărut în toate cele trei bătălii pentru campionat de la începutul formatului Chase
Ca un adevărat pilot de curse, Sauter continuă să concureze la nivel local în statul său natal, Wisconsin, unde locuiește cu soția sa Cortney și cei patru copii ai lor.