În 1938, Bayer a emigrat în Statele Unite și a locuit în New York. În același an, a proiectat expoziția Bauhaus 1919-1928 din New York. 30 de ani mai târziu, expoziția 50 Jahre Bauhaus (50 de ani de Bauhaus) din Stuttgart a fost, de asemenea, amenajată după proiectul său. În SUA, a fost activ în principal ca pictor, grafician publicitar și designer de expoziții și a lucrat pentru numeroase companii și instituții. În 1942, Bayer a proiectat expoziția de propagandă americană Road to Victory la Muzeul de Artă Modernă din New York. În 1945, Irene Bayer a divorțat de el. Începând cu 1946, Bayer a lucrat în calitate de consultant în design la Centrul Cultural Aspen. Apoi, în 1956, a devenit director al departamentului de design la Container Corporation of America. Între 1958 și 1961, a fost membru al consiliului de artă al biroului de informații din SUA. De asemenea, în 1965 a început să lucreze ca și consultant creativ pentru o serie de agenții de publicitate și magazine importante.

Opera sa este foarte diversă, variind de la grafică și pictură la arhitectură peisagistică. Printre lucrările sale remarcabile se numără fotomontajul Selbstporträt (Autoportret) din 1932, publicitatea pentru Adrianol Emulsion din 1935, seria Mountains and Convolutions creată între 1944 și 1953 și Marble Garden (Grădina de marmură) din 1955.

.