Gene Expression Heterogeneity

Joseph Rodriguez, Ph.D.
Principal Investigator Tel 984-287-3104
[email protected]

Research Summary

Obecna technologia pozwala grupie na obrazowanie miejsc transkrypcji w czasie rzeczywistym, co prowadzi do zrozumienia jak regulowana jest heterogeniczność ekspresji genów.

Joseph Rodriguez, Ph.D., prowadzi Grupę Dynamiki Pojedynczych Komórek i posiada dodatkową nominację w NIEHS Signal Transduction Laboratory. Grupa Single Cell Dynamics bada, jak środowisko wpływa na zmienność ekspresji na poziomie pojedynczej komórki, a następnie jak ta zmienność wpływa na decyzje dotyczące losu komórki.

Zrozumienie regulacji genów przez grupę opiera się głównie na badaniach, w których badane są całe tkanki i lizaty komórkowe. Grupa Single Cell Dynamics jest zainteresowana zrozumieniem, dlaczego genetycznie identyczne komórki reagują heterogenicznie na bodźce środowiskowe. Ostatnie badania sugerują, że w chorobach, takich jak nowotwory czy proces starzenia się, zmienność ekspresji w tkankach wzrasta. Określenie czynników i mechanizmów regulujących tę zmienność pomoże nam zrozumieć różnice między stanami prawidłowymi i chorobowymi.

Główne obszary badań:

• Określenie mechanizmów heterogeniczności ekspresji
• Określenie, w jaki sposób decyzje dotyczące losów komórek są regulowane w pojedynczych komórkach

Obrazowanie transkrypcji w żywych komórkach ujawnia głębokie okresy represji, które powodują heterogeniczność ekspresji.

Rodriguez ukończył MIT w 2001 roku i pracował przez sześć lat wykonując bioinformatyczną analizę montażu ludzkiego genomu. W 2007 roku rozpoczął pracę pod kierunkiem laureata Nagrody Nobla, dr Michaela Rosbasha, na Uniwersytecie Brandeis, badając przetwarzanie RNA i dynamikę ekspresji genów w rytmie okołodobowym. Prace te zaowocowały jedenastoma publikacjami, w tym artykułami pierwszego autora w Molecular Cell i Proceedings of the National Academy of Sciences. Po uzyskaniu doktoratu w 2012 roku Rodriguez dołączył do laboratorium dr Daniela Larsona w National Cancer Institute i badał regulację transkrypcyjną genów reagujących na estrogen w pojedynczych komórkach ludzkich. Dołączył do NIEHS w 2018 r.

.