Nie wiadomo, co się stało.

Wiemy, co się nie stało. Popularna teoria fanów mówi, że był jakiś rodzaj Kataklizmu, w którym Zero się uwolnił i zabił wszystkich. Zostało to jednoznacznie odrzucone przez samego Keijiego Inafune.

Wily jest sugerowany jako ten, który przeżył dzięki Wirusowi Maverick i jest zdecydowanie tym, który stworzył go i Zero. Przynajmniej co do tego nie ma żadnych wątpliwości.

Gdybym miał zgadywać:Roll prawdopodobnie skończył zużyty później.

Blues/Protoman prawdopodobnie zginął z powodu swojej nierównowagi energetycznej.

Prawdopodobnie Megaman i Forte/Bass ostatecznie zabili się nawzajem.

Zdrowie Lighta ewidentnie szwankowało w retrospekcjach Day of Sigma, więc jest prawdopodobne, że po prostu umarł z przyczyn naturalnych.

Silnie sugerowane, ale nigdy nie potwierdzone, jest to, że Wily przesłał swój umysł do komputera.

Alternatywny los Megamana mógłby być taki: Jednym z Mistrzów Robotów Dr. Wily’ego jest Quint, przeprogramowana wersja Megamana, którą Wily ukradł z 34 lat w przyszłość. W tym czasie walka Megamana dobiegła końca, a jego części bojowe zostały usunięte, więc Wily dał mu nowe, próbując zabić jego przeszłe ja. Oczywiście Megaman go pokonał, ale – i to z pamięci, nie mam nic na poparcie tej tezy – jestem całkiem pewien, że Quint nie został tak naprawdę zniszczony

Nie jestem pewien, co się tam stało

.