W 1775 roku Biddle powrócił do Ameryki Północnej, aby zaoferować swoje usługi dla stanu Pensylwania w przeciwstawianiu się brytyjskim rządom. Wraz z wybuchem amerykańskiej wojny rewolucyjnej, Pennsylvania Committee of Safety powierzyła Biddle’owi dowództwo uzbrojonej galery Franklin. W grudniu 1775 roku Biddle został wcielony do Marynarki Kontynentalnej i mianowany kapitanem 14-działowego brygu Andrew Doria.

Biddle uczestniczył w ekspedycji przeciwko New Providence i walczył w akcji Marynarki Kontynentalnej z HMS Glasgow 6 kwietnia 1776 roku. Biddle był bardzo krytyczny wobec tej akcji, zauważając, że brak sygnalizacji przez komodora Esek Hopkinsa doprowadził do akcji „helter skelter”. W późniejszych rejsach Biddle zdobywał liczne statki, w tym transporty armii brytyjskiej.

Biddle wziął później udział w rejsie po ławicach Nowej Fundlandii, który był tak udany w zdobywaniu statków, że kiedy Biddle wrócił do portu, na pokładzie jego okrętu pozostało tylko pięciu marynarzy; reszta stanowiła załogi zdobytych podczas rejsu nagród.

6 czerwca 1776 roku Biddle został wyznaczony przez Kongres Kontynentalny do dowodzenia Randolphem, 32-gunową fregatą budowaną wówczas w Filadelfii. Zwodowano ją pod koniec tego roku i wypłynęła na początku 1777. We wrześniu 1777 Biddle zdobył HMS True Briton i jej trzystatkowy konwój.

7 marca 1778 u wybrzeży Barbadosu Randolph zaangażował brytyjski 64-gunowy okręt liniowy HMS Yarmouth. Zamiast próbować uciekać przed silniej uzbrojonym przeciwnikiem, Randolph zaangażował się w walkę, aby chronić amerykański konwój handlowy. Naoczny świadek doniósł, że fregata trzymała się dzielnie w dwudziestominutowym starciu, zdając się „strzelać czterema lub pięcioma burtami do jednej Yarmoutha”. Po tym jak Biddle został ranny, Randolph nagle wybuchł, zabijając wszystkich oprócz czterech 305 osób na pokładzie, łącznie z Biddle’em. Strata Randolpha była poważnym ciosem dla świeżo upieczonej Marynarki Kontynentalnej. Jego ciało zaginęło na morzu i nigdy nie zostało odnalezione.

Jego brat, Edward Biddle, był zagorzałym zwolennikiem amerykańskiej niepodległości, a jego siostrzeniec, Nicholas Biddle, był cenionym bankierem.

Cztery okręty Marynarki Wojennej Stanów Zjednoczonych zostały nazwane USS Biddle na jego cześć.

Cyrus Townsend Brady w swojej książce For Love of Country opiera się częściowo na życiu Nicholasa Biddle’a.

Książka „For Love of Country” jest oparta częściowo na życiu Nicholasa Biddle’a.