1999-2004: Onset of Putrefaction i EpitaphEdit
Debiutancki album Necrophagist, Onset of Putrefaction, od lat nie jest już drukowany. Perkusja na płycie była obsługiwana przez automat perkusyjny. Ostatecznie powstała nowa edycja z samplami perkusyjnymi nagranymi przez Hannesa Grossmanna. Wszystkie stare ścieżki gitary, gitary basowej i wokalu zostały zmiksowane z nowymi próbkami perkusji. Na reedycji znalazły się również dwa utwory z kasety demo Necrophagist z 1995 roku. Cały album został wyprodukowany przez wieloletniego inżyniera i producenta Necrophagist Christopha Brandesa w The Iguana Studios. Masteringiem zajął się Bob Katz w „Digital Domain” w Orlando na Florydzie. Reedycja została wydana w 2004 roku przez Willowtip w Stanach Zjednoczonych/Kanadzie i Relapse w pozostałych częściach świata. W sierpniu 2001 Necrophagist wystąpił na festiwalu Brutal Assault w Czechach. Zespół powrócił również do koncertowania w latach 2003, 2005 i 2010.
2004-2012: Trasy koncertowe i ciągłe zmiany składuEdit
10 lutego 2006 roku ogłoszono, że Christian Münzner odszedł z zespołu z powodu konfliktów terminarzowych. Później dołączył on do death metalowej grupy Obscura. Znaleziono gitarzystę zastępczego, którym został Sami Raatikainen, pochodzący z Helsinek w Finlandii. Sami gra również w zespole Codeon.
W 2006 roku zespół wyruszył w amerykańską trasę koncertową zatytułowaną „Carving North America’s Epitaph”. Do Necrophagist na tej trasie dołączyli Arsis, Alarum, Neuraxis, Ion Dissonance, Cattle Decapitation i Thine Eyes Bleed. Wraz z Dying Fetus, wspierali Cannibal Corpse na ich trasie po Stanach Zjednoczonych jesienią, która obejmowała również niektóre kanadyjskie miejsca.
W 2007 roku, zespół ogłosił na swoim profilu Myspace, że po kalifornijskim Metalfest 2007, perkusista Hannes Grossmann opuści zespół. Hannes stwierdził, że nie jest w stanie poświęcić się w pełni harmonogramowi tras koncertowych zespołu. Marco Minnemann (który grał z Paulem Gilbertem, Terrym Bozzio, Chadem Wackermanem) został oficjalnym stałym zastępcą Hannesa.
Necrophagist był główną gwiazdą The Summer Slaughter Tour w 2007 roku, na której wystąpiło wiele innych ekstremalnych zespołów metalowych, w tym Decapitated, Arsis, The Faceless, Cephalic Carnage, As Blood Runs Black i Cattle Decapitation.
W kwietniu 2008 Necrophagist ogłosił, że Romain Goulon dołączy do zespołu jako nowy perkusista, zastępując Minnemanna, który nadal będzie pracował z Suiçmezem nad projektem pobocznym.
Necrophagist grał w „Pillage the Village Tour” w 2008 roku od 26 sierpnia 2008 do 10 września 2008 z death metalowymi zespołami Dying Fetus i Beneath the Massacre. Występy w niektórych rejonach obejmowały również Carcass, Suffocation, 1349 i Aborted.
W 2008 roku Necrophagist rozpoczął pracę nad kolejnym albumem z nowym perkusistą Romainem Goulonem. Według plotek, dwie możliwe nazwy to „The Path to Naught” i „Death to the Faithful”. Suiçmez zapowiedział, że na płycie zespół będzie używał siedmiostrunowych gitar. Sam Muhammed będzie nagrywał na nowej, customowej gitarze Ibanez Xiphos z siedmioma strunami i 27 progami. Sami Raatikainen jest teraz Ibanez Guitar endorser, używając 7 String RG-Series gitara na scenie.
2012-: HiatusEdit
Od 2012 roku nie wiadomo, czy Necrophagist są nadal aktywni, czy też mają plany wydania kontynuacji Epitaph. Doprowadziło to do dużej ilości spekulacji ze strony fanów, zdumionych długim oczekiwaniem na album. Jednakże, w oświadczeniu wydanym w sierpniu 2012 roku, były perkusista Marco Minnemann stwierdził, że rzeczywiście są postępy w pracach nad nowym albumem, mówiąc „Wiem, że ludzie tak bardzo czekają na nowy album Necro. Muhammed jest moim bardzo bliskim przyjacielem i wiem, że bardzo zależy mu na tym, aby wydać jak najlepszy album. Ale osobiście wiem, że jest tam postęp….hang on, jestem pewien, że dostarczy towar.”
W dniu 11 września 2013 roku perkusista Romain Goulon wydał oświadczenie, że Necrophagist są nadal aktywni i próbują nagrać nowy album, jednak nie podano kiedy zostanie on wydany. Następnie, 4 kwietnia 2016 roku, Goulon odpowiedział na komentarz na Facebooku i stwierdził „Szukamy trumny, aby opłakiwać zmarłych”, sugerując, że Necrophagist nie będzie się rozwijać jako zespół.
.