Choroby objęte NPIP to ptasia grypa (pomór drobiu) oraz choroby wywoływane przez S. pullorum (choroba pullorum), S. gallinarum (tyfus ptasi), S. enterica var. enteritidis, Mycoplasma gallisepticum (MG, przewlekła choroba układu oddechowego i zakaźne zapalenie zatok u indyków), M. synoviae (MS, zakaźne zapalenie błony maziowej) i M. meleagridis (MM, jednodniowe zapalenie żołądka i jelit). Ponadto, NPIP posiada programy takie jak „U.S. Salmonella Monitored” i „U.S. Sanitation Monitored”, które mają na celu zmniejszenie występowania organizmów salmonelli w jajach wylęgowych, kurczętach i pisklętach poprzez skuteczne i praktyczne procedury sanitarne na fermie hodowlanej i w wylęgarni.

Drób jest zdefiniowany w NPIP jako ptactwo domowe, w tym kurczaki, indyki, strusie, emusy, rea, sasanki, ptactwo wodne i ptactwo łowne (z wyjątkiem gołębi i gołębi), które są hodowane głównie w celu produkcji jaj i mięsa. W programie NPIP biorą udział trzy rodzaje uczestników: niezależne stada, wylęgarnie i pośrednicy. Produkty drobiowe certyfikowane przez NPIP to jaja wylęgowe, pisklęta, kurczęta i młode kury. Zdecydowana większość stanów USA zakazuje wwozu jakichkolwiek przesyłek drobiu z wyjątkiem tych, które są oznaczone jako czyste od pullorum – tyfusu. Zasadniczo, takie zakazy oznaczają, że drób przemieszczający się między państwami powinien uczestniczyć w programie „U.S. Pullorum-Typhoid Clean” prowadzonym przez NPIP lub zostać przebadany z wynikiem negatywnym na obecność pullorum-typhoid przed opuszczeniem swojego państwa pochodzenia. Piętnaście stanów wymaga, aby wszystkie przesyłki indyków, które otrzymują, były czyste pod względem MG. Zasadniczo wymóg ten oznacza, że indyki przewożone między państwami powinny uczestniczyć w programie „U.S. MG Clean” prowadzonym przez NPIP lub zostać przebadane na obecność MG przed wysyłką.

Większość amerykańskich partnerów handlowych importujących drób i produkty ze Stanów Zjednoczonych również wymaga uczestnictwa w NPIP. Akredytowani lekarze weterynarii mogą zostać poproszeni o przeprowadzenie inspekcji stad hodowlanych uczestniczących w NPIP pod kątem zgodności z normami oraz o wystawienie świadectw zdrowia. Każdej wiosny APHIS publikuje katalog uczestników zajmujących się kurczętami i indykami typu jajecznego i mięsnego oraz katalog uczestników zajmujących się ptactwem wodnym, drobiem wystawowym, ptactwem łownym i ptakami bezgrzebieniowymi. Katalogi te zawierają listę wylęgarni, niezależnych stad i pośredników uczestniczących w NPIP, produkty, którymi się zajmują, oraz klasyfikacje chorób, w których uczestniczą.