Flaviviradae to duża rodzina patogenów wirusowych odpowiedzialnych za wywoływanie ciężkich chorób i śmiertelności u ludzi i zwierząt. Rodzina ta składa się z trzech rodzajów: Flavivirus, Pestivirus i Hepacivirus. Rodzaj Flavivirus, który jest największym z trzech rodzajów, zawiera ponad 70 wirusów, w tym wirus dengi (DV), wirus japońskiego zapalenia mózgu (JEV), wirus Zachodniego Nilu (WNV), wirus żółtej gorączki (YFV) i wirus Zika (ZIKV). Flawiwirusy wykazują jednorodność morfologiczną z ikozaedrycznym kapsydem i ściśle przylegającą, kolczastą otoczką. Wielkość kapsydu wynosi około 30 nm, a cały wirion mierzy 45 nm. Genom flawiwirusów jest jednoniciowym, sensownym RNA o wielkości około 10 kb. Koduje on 3 białka strukturalne: kapsydu (białko C), błony (M, które jest wyrażane jako prM, prekursor białka M i otoczki (białko E) oraz 7 białek niestrukturalnych: NS1, NS2A, NS2B, NS3, NS4A, NS4B i NS5 (rysunek 1 a,b).

Cząstki flawiwirusów (a), białka (b) i cykl życiowy (c)

Rysunek 1. Cząstki flawiwirusów (a), białka (b) i cykl życiowy (c).

Browse All Flavivirus Related Products

Cykl życiowy flawiwirusów:
Wirusy przyczepiają się do powierzchni komórki gospodarza, a następnie wnikają do komórki przez endocytozę pośredniczoną przez receptor (Rysunek 1c). Zidentyfikowano kilka receptorów pierwotnych i współreceptorów o niskim powinowactwie dla flawiwirusów. Zakwaszenie pęcherzyka endosomalnego wyzwala zmiany konformacyjne wirionu, fuzję błony wirusowej i komórkowej oraz rozpad cząsteczki. Po uwolnieniu genomu do cytoplazmy, dodatnio-sensowny RNA ulega translacji do pojedynczej poliproteiny, która jest przetwarzana współ- i potranslacyjnie przez proteazy wirusowe i gospodarza. Replikacja genomu zachodzi na błonach wewnątrzkomórkowych. Składanie wirusa zachodzi na powierzchni retikulum endoplazmatycznego (ER), gdy białka strukturalne i nowo zsyntetyzowane RNA pączkują do światła ER. Powstałe w ten sposób nieinfekcyjne, niedojrzałe cząstki wirusowe i subwirusowe są transportowane przez sieć trans-Golgiego (TGN). Niedojrzałe cząstki wirionów są rozszczepiane przez proteazę gospodarza – furynę, w wyniku czego powstają dojrzałe, zakaźne cząstki. Cząstki subwirusowe są również rozszczepiane przez furynę. Dojrzałe wirusy i cząstki subwirusowe są następnie uwalniane przez egzocytozę.

Epidemiologia flawiwirusów:
Flawiwirusy przenoszone przez komary są przenoszone w przyrodzie w jednym lub więcej odrębnych lub nakładających się cyklach, które obejmują wektora komara, na ogół komary Aedes dla YFV i DENV oraz komary Culex dla JEV i WNV, oraz ssaka lub ptaka-gospodarza. Transmisja pomiędzy komarami a żywicielami kręgowymi jest określana jako transmisja pozioma i powoduje choroby u kręgowców. W przeciwieństwie do transmisji poziomej, flawiwirusy przenoszone przez komary mogą być utrzymywane w środowisku poprzez transmisję pionową, tzn. transmisję transgeneracyjną, która pozwala na rozprzestrzenianie się flawiwirusów wyłącznie w komarach. Najbardziej bezpośredni dowód potwierdzający pionowe przenoszenie flawiwirusów przenoszonych przez komary pochodzi z izolacji wirusa z zainfekowanych larw, przypuszczalnie poprzez transmisję transowarialną. Obserwacja ta jest zgodna z wykrywaniem antygenów wirusowych w tkankach jajników zakażonych komarów. (Rysunek 2)

Trzy typowe komary, które przenoszą choroby

Rysunek 2. Trzy typowe komary, które przenoszą choroby.

Flawiwirusy mają globalne rozmieszczenie, a niektórzy członkowie rodzaju stanowią poważny problem dla zdrowia publicznego (np. wirus żółtej gorączki , wirus dengi , wirus Zachodniego Nilu i wirus japońskiego zapalenia mózgu ), z wysoką zachorowalnością i/lub śmiertelnością. W ostatniej dekadzie flawiwirusy wykazały zwiększoną częstość występowania, stwarzając zagrożenie dla ponad 3 miliardów ludzi na całym świecie, co czyni je paradygmatem pojawiających się chorób.

W ciągu ostatnich 50 lat wiele flawiwirusów, takich jak wirus dengi, Zachodniego Nilu i żółtej gorączki, wykazało dramatyczny wzrost częstości występowania, ciężkości choroby i/lub zasięgu geograficznego. Wirusowe patogeny pochodzące ze środowiska wykazują stosunkowo jednolitą charakterystykę epidemiologiczną. Komary, kleszcze i gryzące muchy służą jako wektory większości ludzkich chorób wirusowych. Choroba u ludzi pojawia się, gdy wektory są aktywne, zazwyczaj wiosną, latem i jesienią w klimacie umiarkowanym, i często wykazuje odrębne cechy epidemiologiczne, które odpowiadają siedlisku wektora (Rysunek 3).

Obszar epidemii 5 typowych flawiwirusów

Rysunek 3. Obszar epidemii 5 typowych flawiwirusów.

Manifestacje:
Flawiwirusy różnią się znacznie pod względem potencjału patogennego i mechanizmów wywoływania chorób u ludzi (Tabela 1). Zakażenie człowieka flawiwirusami przenoszonymi przez komary i kleszcze jest inicjowane przez przeniesienie wirusa przez skórę za pośrednictwem śliny zakażonego stawonoga. Wirus replikuje się lokalnie i w regionalnych węzłach chłonnych, powodując wiremię. Główne syndromy i przykłady wywołujących je flawiwirusów obejmują: zapalenie mózgu (japońskie zapalenie mózgu), chorobę gorączkową z wysypką (wirus dengi), gorączkę krwotoczną (wirus choroby leśnej Kyasanur i czasami wirus dengi) oraz gorączkę krwotoczną z zapaleniem wątroby (wirus żółtej gorączki).

Tabela 1 Przegląd najważniejszych flawiwirusów

Gatunek wirusa Wektor przenoszący Rozprzestrzenianie geograficzne Syndrom.
Żółta gorączka Mosquito (Aedes) Patrz rysunek 3a Gorączka krwotoczna
Denga Mosquito
(Aedes, Stegomyia)
Patrz rysunek 3b Zespół dengi,
DHF, DSS
Gorączka Zachodniego Nilu Komar (Culex),
kleszcze (Argasidae)
Patrz rysunek 3c Zespół dengi,
zapalenie mózgu
japońskie zapalenie mózgu komar (Culex) Patrz rysunek 3d zapalenie mózgu
Zika Mosquito (Aedes) Patrz rysunek 3e Mikrocefalia

Diagnostyka:
Diagnostyka kliniczna różnych flawiwirusów nie jest wiarygodna ze względu na niespecyficzne objawy, a do potwierdzenia etiologii choroby konieczna jest diagnostyka laboratoryjna. W zakażeniach flawiwirusami wirus może być wykryty w surowicy lub osoczu, zazwyczaj po 2-7 dniach od początku choroby, a czas trwania tej fazy wiremii i wykryta wiremia różnią się w zależności od zakażającego wirusa (Tabela 2). Zazwyczaj po 5-7 dniach od początku choroby pojawia się odpowiedź immunologiczna przeciwko zakażeniu, z przeciwciałami IgM, których szczyt pojawia się po 15 dniach. Te przeciwciała IgM mogą utrzymywać się od miesięcy (jak w przypadku DENV) do lat (jak w przypadku zakażeń WNV). Pojawienie się IgG następuje po 8-10 dniach od początku choroby i może być wykrywane przez całe życie. Specyfika każdego z flawiwirusów ma znaczący wpływ na algorytmy diagnostyczne, które należy stosować w rozpoznawaniu zakażeń flawiwirusowych. Ogólnie rzecz biorąc, wiele laboratoriów wybrało testy serologiczne do diagnozowania infekcji wywołanych przez flawiwirusy, ze względu na ich dokładność i dostępność testów komercyjnych opartych na wysokich standardach jakości. Jednakże, obecność serologicznych reakcji krzyżowych pomiędzy różnymi wirusami oraz czas niezbędny do wykrycia przeciwciał w niektórych infekcjach, ograniczają przydatność serologii jako narzędzia diagnostycznego w ostrych infekcjach flawiwirusowych. Izolacja wirusa stanowi „złoty standard” w celu uzyskania potwierdzonej diagnozy flawiwirusa.

Przeglądaj wszystkie produkty Flavivirus ELSIA Kit i Flavivirus RDT

Tabela 2. Algorytmy diagnostyki flawiwirusów.

Faza ostra Faza rekonwalescencji Preferowana próbka† Oczekiwane obciążenie wirusowe
YFV RT-PCR, RT-qPCR, IgM, izolacja wirusa IgM, IgG Serum, osocze i tkanki Wysoka
DENV RT-PCR, RT-qPCR, NS1 Ag, IgM, izolacja wirusa IgM, IgG Serum, osocze, CSF i PBMCs Up to 106 virions/ml
WNV RT-PCR, IgM, IgG IgM, IgG CSF i surowica Low
JEV RT-PCR, IgM, IgG IgM, IgG CSF, surowica, krew i PBMCs Low
ZIKV RT-PCR, IgM, IgG IgM, IgG CSF i surowica Low
Gould E A, Solomon T. Pathogenic flaviviruses . The Lancet, 2008, 371(9611): 500-509.
Gaunt M W, Sall A A, de Lamballerie X, et al. Phylogenetic relationships of flaviviruses correlate with their epidemiology, disease association and biogeography . Journal of General Virology, 2001, 82(8): 1867-1876.
Kuno G, Chang G J J, Tsuchiya K R, et al. Phylogeny of the genus Flavivirus . Journal of virology, 1998, 72(1): 73-83.
Mukhopadhyay S, Kuhn R J, Rossmann M G. A structural perspective of the flavivirus life cycle. Nature Reviews Microbiology, 2005, 3(1): 13-22.
Huang Y J S, Higgs S, Horne K M E, et al. Flavivirus-mosquito interactions. Viruses, 2014, 6(11): 4703-4730.

.

Dodaj komentarz

Twój adres e-mail nie zostanie opublikowany.