As doenças cobertas pelo NPIP são a gripe aviária (peste aviária) e as produzidas por S. pullorum (doença do pulorum), S. gallinarum (febre tifóide aviária), S. enterica var. enteritidis, Mycoplasma gallisepticum (MG, doença respiratória crônica e sinusite infecciosa em perus), M. synoviae (EM, sinovite infecciosa) e M. meleagridis (MM, airsacculitis do dia). Além disso, o NPIP tem programas como o “U.S. Salmonella Monitored” e o “U.S. Sanitation Monitored” que se destinam a reduzir a incidência de organismos salmonela nos ovos de incubação, pintos e cataplasmas através de procedimentos sanitários eficazes e práticos na granja de criação e no incubatório.
Aves de capoeira é definida no NPIP como aves domésticas, incluindo galinhas, perus, avestruzes, emas, emas, casulos, aves aquáticas e aves de caça (excepto pombas e pombos) que são criadas principalmente para produzir ovos e carne. Três tipos de participantes estão envolvidos no NPIP: bandos independentes, incubadoras e comerciantes. Os produtos avícolas certificados pelo NPIP são ovos para incubação, pintos bebés, cataplasmas e galinhas poedeiras. A grande maioria dos Estados Unidos da América proíbe a entrada de qualquer carregamento de aves de capoeira, exceto aquelas designadas como pulorum- tifóide limpo. Essencialmente, tais proibições significam que as aves que se deslocam entre estados devem participar do programa “U.S. Pullorum-Typhoid Clean” do NPIP ou ser testadas negativas para pullorum-typhoid antes de deixarem o seu estado de origem. Quinze Estados exigem que todos os carregamentos de perus que recebem sejam MG limpos. Essencialmente, essa exigência significa que os perus que se deslocam entre estados devem participar do programa “U.S. MG Clean” do NPIP ou ser testados livres de MG antes do embarque.
A maioria dos parceiros comerciais dos EUA que importam aves e produtos dos Estados Unidos também exigem a participação do NPIP. Veterinários credenciados podem ser solicitados a inspecionar os lotes de matrizes que participam do NPIP para verificar o cumprimento das normas e emitir certificações sanitárias. Toda primavera, a APHIS publica um diretório de participantes manuseando frangos e perus do tipo ovo e de carne e um diretório de participantes manuseando aves aquáticas, aves de exposição, aves de caça e ratites. Esses diretórios listam incubatórios, bandos independentes e revendedores participantes do NPIP, os produtos que manipulam e as classificações de doenças das quais participam.