Nanoscale Molecular Dynamics (NAMD, anteriormente Not Another Molecular Dynamics Program) é um software de computador para simulação de dinâmica molecular, escrito usando o modelo de programação paralela Charm++. É conhecido pela sua eficiência paralela e é frequentemente utilizado para simular grandes sistemas (milhões de átomos). Foi desenvolvido pela colaboração do Grupo de Biofísica Teórica e Computacional (TCB) e do Laboratório de Programação Paralela (PPL) da Universidade de Illinois em Urbana-Champaign.

Dinâmica Molecular em Nanoescala

Desenvolvedor(es)

Universidade de Illinois em Urbana-Champaign: Grupo de Biofísica Teórica e Computacional (TCB), Laboratório de Programação Paralela (PPL)

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Lançamento inicial

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1995; 26 anos atrás

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Lançamento estável

Repositório

Escrito em

C++

Sistema operacional

Plataforma cruzada: Windows, Linux, macOS, Unix

Plataforma

x86, x86-64

Disponível em

Português

Tipo

Simulação da dinâmica molecular

Licença

Proprietário, freeware para uso não comercial

Website

wwww.ks.uiuc.edu/Research/namd

Foi introduzido em 1995 por Nelson et al. como um código de dinâmica molecular paralelo permitindo a simulação interativa através da ligação com o código de visualização VMD. O NAMD amadureceu desde então, adicionando muitas características e escalas além de 500.000 núcleos de processador.

NAMD tem uma interface para pacotes de química quântica ORCA e MOPAC, bem como uma interface com scripts para muitos outros pacotes quânticos. Juntamente com Visual Molecular Dynamics (VMD) e QwikMD, a interface do NAMD fornece acesso a simulações híbridas QM/MM em um conjunto integrado, abrangente, personalizável e fácil de usar.

NAMD está disponível como freeware para uso não-comercial por indivíduos, instituições acadêmicas e corporações para usos comerciais internos.