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Akers foi membro da seleção nacional feminina de futebol dos Estados Unidos de 1985 (USWNT) em seu primeiro jogo, em um torneio na Itália, em agosto de 1985. Devido a uma lesão no tornozelo, ela não jogou no primeiro jogo. No entanto, no segundo jogo internacional dos EUA, ela marcou o primeiro gol da história do programa, num empate de 2-2 contra a Dinamarca.
Akers marcou 15 gols em 24 jogos para os EUA de 1985 a 1990, antes de marcar um recorde de 39 gols em 26 jogos na temporada de 1991. Em 1990 e 1991 ela foi nomeada a Atleta Feminina do Ano pela Federação de Futebol dos Estados Unidos (USSF). Akers também foi a artilheira da primeira Copa do Mundo Feminina da FIFA na China, em 1991, marcando dez gols, incluindo cinco em um jogo. Isso levou a seleção feminina dos EUA ao primeiro campeonato mundial feminino, derrotando a Noruega por 2 a 1 na final. Após a Copa do Mundo de 1991, ela passou de atacante a meio-campista central, em parte para minimizar as pancadas das defesas adversárias. Apesar das precauções, Akers sofreu uma contusão e uma lesão no joelho no início da Copa do Mundo de 1995, e foi prejudicada pelo joelho na derrota dos EUA na semifinal para a Noruega.
Em 1996, Akers foi novamente membro da seleção feminina dos EUA nas Olimpíadas de Verão de 1996 em Atlanta, Geórgia, onde ganhou a primeira medalha de ouro no futebol feminino olímpico. Ela jogou com um ligamento colateral medial rasgado no papel de meia-atacante, ancorando a defesa da equipe, dominando no ar, e jogando pelas costas para manter a posse de bola e gerar oportunidades de marcar gols. Após o torneio, o joelho dela precisou de uma cirurgia reconstrutiva pela terceira vez. Ela também foi membro da equipe ganhadora da medalha de ouro nos Jogos de Boa Vontade de 1998. Em 7 de junho de 1998, ela recebeu a Ordem de Mérito da FIFA, a maior honra da FIFA no jogo global de futebol, por suas contribuições para o jogo de futebol dentro e fora de campo; ela foi a primeira mulher a recebê-la. Akers foi novamente líder e membro da equipe da Copa do Mundo Feminina de 1999, onde a equipe venceu seu segundo campeonato mundial de futebol. Apesar de jogar com um ombro deslocado, causado por um torcedor nas quartas de final, ela recebeu a Bola de Bronze do torneio pela FIFA.
Pouco antes dos Jogos Olímpicos de Verão de 2000 em Sydney, Austrália, Akers se aposentou do jogo devido a lesões ocorridas antes e durante a Copa do Mundo da FIFA 1999. Ela foi a segunda maior artilheira da seleção dos EUA (atrás de Mia Hamm) com 105 gols, 37 assistências e 247 pontos.