Para identificar os genes e funções gênicas subjacentes aos aspectos chave da biologia das leguminosas, os pesquisadores selecionaram a truncatula da estação fria Medicago como um sistema modelo para a pesquisa de leguminosas. A missão do Consórcio M. truncatula é promover o compartilhamento irrestrito de dados e informações que são fornecidos por grupos de pesquisa Medicago em todo o mundo. Através da integração de uma variedade de dados e ferramentas, o site medicago.org pretende facilitar o progresso nos campos da genômica estrutural, comparativa e funcional. Para este objetivo, e como parceiro do consórcio, o Centro de Genômica Computacional e Bioinformática (CCGB) da Universidade de Minnesota desenvolveu o MtDB2.0, a base de dados M. truncatula versão 2.0. O banco de dados MtDB2.0 é o primeiro passo para a integração global da informação genômica, genética e biológica da M. truncatula. MtDB2.0 é uma base de dados relacional que integra os dados do M. truncatula transcriptome e fornece uma ampla gama de opções de mineração de dados definidas pelo usuário. A base de dados é interrogada através de uma série de interfaces, com 58 opções agrupadas em dois filtros. Os identificadores sequenciais de todos os sites públicos da M. truncatula são totalmente cruzados para facilitar comparações entre diferentes sites, e links de hipertexto para os registros apropriados da base de dados são fornecidos para todos os resultados das consultas. O objetivo do MtDB é fornecer aos pesquisadores os meios para identificar rápida e independentemente seqüências que correspondam aos interesses específicos da pesquisa, com base em critérios definidos pelo usuário. O MtDB2.0 oferece acesso irrestrito a ferramentas avançadas e poderosas de consulta sem igual em qualquer outro banco de dados público. As consultas codificadas em linguagem de consulta Structurad Query Language (SQL) com uma interface Web baseada em Java, incorporam diferentes filtros que permitem a extração sofisticada de dados dos resultados do projeto de seqüenciamento de tags de seqüências expressas, incluindo o conjunto CCGB M. truncatula Unigene gerado com o assembler Phrap. O banco de dados subjacente e o software de consulta foram projetados para facilitar as atualizações e a portabilidade para outros organismos do modelo. O acesso público à base de dados está em http://www.medicago.org/MtDB.

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