Per identificare i geni e le funzioni geniche che sono alla base degli aspetti chiave della biologia dei legumi, i ricercatori hanno selezionato il legume di stagione fredda Medicago truncatula come sistema modello per la ricerca sui legumi. La missione del Consorzio M. truncatula è di promuovere la condivisione illimitata dei dati e delle informazioni fornite dai gruppi di ricerca di Medicago in tutto il mondo. Attraverso l’integrazione di una varietà di dati e strumenti, il sito medicago.org intende facilitare il progresso nei campi della genomica strutturale, comparativa e funzionale. A questo scopo, e come partner del consorzio, il Center for Computational Genomics and Bioinformatics (CCGB) dell’Università del Minnesota ha sviluppato MtDB2.0, il database M. truncatula versione 2.0. Il database MtDB2.0 è il primo passo verso l’integrazione globale delle informazioni genomiche, genetiche e biologiche di M. truncatula. MtDB2.0 è un database relazionale che integra i dati del trascrittoma di M. truncatula e fornisce una vasta gamma di opzioni di data mining definite dall’utente. Il database viene interrogato attraverso una serie di interfacce, con 58 opzioni raggruppate in due filtri. Gli identificatori di sequenza di tutti i siti pubblici di M. truncatula sono completamente incrociati per facilitare i confronti tra siti diversi, e i collegamenti ipertestuali ai record appropriati del database sono forniti per tutti i risultati delle query. L’obiettivo di MtDB è di fornire ai ricercatori i mezzi per identificare rapidamente e indipendentemente le sequenze che corrispondono a specifici interessi di ricerca basati su criteri definiti dall’utente. MtDB2.0 offre un accesso illimitato a strumenti di interrogazione avanzati e potenti ineguagliati da qualsiasi altro database pubblico. Le query codificate in Structurad Query Language (SQL) con un’interfaccia utente Web basata su Java, incorporano diversi filtri che permettono un sofisticato data mining dei risultati del progetto di sequenziamento dei tag di sequenza espressi, compreso il set CCGB M. truncatula Unigene generato con l’assemblatore Phrap. Il database sottostante e il software di interrogazione sono stati progettati per la facilità di aggiornamento e la portabilità ad altri organismi modello. L’accesso pubblico al database è a http://www.medicago.org/MtDB.