In bioinformatica, miRBase è un database biologico che funge da archivio di sequenze e annotazioni di microRNA. A settembre 2010 conteneva informazioni su 15.172 microRNA. Questo numero è salito a 38.589 a marzo 2018. Il registro miRBase fornisce un sistema centralizzato per assegnare nuovi nomi ai geni microRNA.
microRNA database
Università di Manchester
Ana Kozomara
Kozomara & al. (2011)
www.mirbase.org
miRBase è cresciuto dalla risorsa registro microRNA istituito da Sam Griffiths-Jones nel 2003.
Secondo Ana Kozomara e Sam Griffiths-Jones miRBase ha cinque obiettivi:
- Fornire un sistema di denominazione coerente per i microRNA
- Fornire un luogo centrale che raccolga tutte le sequenze note di microRNA
- Fornire informazioni leggibili dall’uomo e dal computer per ogni microRNA
- Per fornire prove primarie per ogni microRNA
- Per aggregare e collegare le informazioni sui target dei microRNA
MiRBase contiene miRNA appartenenti a varie specie appartenenti a Alveolata, Chromalveolata, Metazoa, Mycetozoa, Viridiplantae e Virus. Per i Viridiplantae, nella versione 21 (2014) i dati sono disponibili per 73 specie. Questo include 4800 miRNA maturi unici e 8480 sequenze di precursori.
La versione attuale di MiRBase è la release 22 (marzo 2018).