Le prime miniere di pietra sotterranee cominciarono ad apparire nel XIX secolo, mentre una vigorosa costruzione aveva luogo a Odessa. Venivano utilizzate come fonte di materiali da costruzione a basso costo. Il calcare veniva tagliato con seghe, e l’estrazione divenne così intensa che nella seconda metà del XIX secolo, la vasta rete di catacombe creò molti disagi alla città.
Dopo la rivoluzione russa del 1917, l’estrazione della pietra fu vietata nella parte centrale di Odessa (all’interno della zona Porto-Franko, delimitata dalle vie Vecchio Porto Franko e Panteleymonovskaya).
Durante la seconda guerra mondiale le catacombe servirono come nascondiglio per i partigiani sovietici, in particolare la squadra di Vladimir Molodtsov. Nella sua opera Le onde del Mar Nero, Valentin Kataev descrisse la battaglia dei partigiani sovietici contro le forze dell’asse, sotto Odessa e il suo vicino sobborgo Usatove.
Nel 1961 fu creato il club “Search” (Poisk) per esplorare la storia del movimento partigiano nelle catacombe. Dalla sua creazione, ha ampliato la comprensione delle catacombe, e ha fornito informazioni per espandere la mappatura dei tunnel.
La città ha una grande popolazione di oltre 1 milione di persone, che secondo alcuni beneficerebbe dell’introduzione di un sistema di metropolitana. I tunnel sono stati citati come il motivo per cui un tale sistema di metropolitana non è mai stato costruito a Odessa.
Dall’inizio del 21° secolo l’estrazione del calcare è continuata nelle miniere situate a Dofinovka, Byldynka, e “Fomina balka” vicino a Odessa. Come risultato dell’estrazione contemporanea, le catacombe continuano ad espandersi.