Gene Expression Heterogeneity

Joseph Rodriguez, Ph.D.
Principal Investigator Tel 984-287-3104
[email protected]

Kutatási összefoglaló

A jelenlegi technológia lehetővé teszi a csoport számára, hogy valós időben képet készítsen a transzkripciós helyekről, ami a génexpresszió heterogenitásának szabályozásának megértéséhez vezet.

Joseph Rodriguez, Ph.D., vezeti az Egysejtdinamikai Csoportot, és másodállásban a NIEHS Szignáltranszdukciós Laboratóriumában dolgozik. Az Egysejtdinamikai Csoport azt vizsgálja, hogy a környezet hogyan befolyásolja az expressziós variabilitást az egyes sejtek szintjén, és később hogyan befolyásolja ez a variabilitás a sejtsorsra vonatkozó döntéseket.

A csoport génszabályozással kapcsolatos ismeretei többnyire teljes szöveteket és ömlesztett sejtlizátumokat vizsgáló vizsgálatokon alapulnak. Az Egysejtdinamikai Csoport annak megértése iránt érdeklődik, hogy a genetikailag azonos sejtek miért reagálnak heterogén módon a környezeti ingerekre. A legújabb kutatások azt sugallják, hogy betegségekben, mint például a rák vagy az öregedés folyamata, az expressziós variabilitás megnő a szövetekben. Az ezt a variabilitást szabályozó tényezők és mechanizmusok meghatározása segít megérteni a normális és a beteg állapotok közötti különbségeket.

Főbb kutatási területek:

• Az expressziós heterogenitás mechanizmusainak meghatározása
• A sejtsorsdöntések szabályozásának meghatározása egyes sejtekben

A transzkripció képalkotása élő sejtekben mély repressziós periódusokat tár fel, amelyek expressziós heterogenitást okoznak.

Rodriguez 2001-ben végzett az MIT-n, és hat évig dolgozott az emberi genom összeállításának bioinformatikai elemzésével. 2007-ben a Nobel-díjas Michael Rosbash, Ph.D. vezetésével kezdett el dolgozni a Brandeis Egyetemen, ahol az RNS-feldolgozást és a cirkadián génexpresszió dinamikáját tanulmányozta. Ezek az erőfeszítések tizenegy publikáció közös szerzőségéhez vezettek, köztük a Molecular Cell és a Proceedings of the National Academy of Sciences című folyóiratokban megjelent első szerzői munkákhoz. Doktori fokozatának 2012-es megszerzése után Rodriguez Daniel Larson, Ph.D. laboratóriumához csatlakozott a National Cancer Institute-ban, és az ösztrogénre reagáló gének transzkripciós szabályozását tanulmányozta egyes emberi sejtekben. 2018-ban csatlakozott a NIEHS-hez.