1960 elején Ruby egyike volt annak a hat fekete gyereknek New Orleansban, akik átmentek a teszten, hogy eldöntsék, járhatnak-e a fehér William Frantz általános iskolába. A hatból ketten úgy döntöttek, hogy a régi iskolájukban maradnak, Ruby egyedül ment iskolába, három gyereket pedig áthelyeztek a 19. számú McDonoghba, és McDonogh Hármas néven váltak ismertté. Rubyt és édesanyját az egész első évben nem kevesebb, mint négy szövetségi rendőrbíró kísérte az iskolába.
Ruby apja kezdetben vonakodott, míg édesanyja úgy érezte, hogy nemcsak a lányának kell jobb oktatást biztosítani, hanem “meg kell tenni ezt a lépést… minden afroamerikai gyermekért”. Az asszony végül meggyőzte a férjét, hogy engedje iskolába járni.
J. Skelly Wright bíró 1960. november 14-én hozott ítéletét az integrált iskolák első napjáról New Orleansban Norman Rockwell megemlékezett The Problem We All Live With című festményén (a Look 1964. január 14-én jelent meg). Ahogy Ruby maga írja: “Amikor felmentem, láttam a tömeget, de mivel New Orleansban éltem, azt hittem, hogy ez a Mardi Gras. Az iskola előtt nagy volt a tömeg. Dobálták a dolgokat és kiabáltak, és ilyen dolgok történnek New Orleansban a Mardi Gras idején.” Charles Burks, az amerikai marsall egykori helyettese így emlékezett vissza: “Nagy bátorságról tett tanúbizonyságot. Soha nem sírt vagy nyafogott. Amint Rubyt felvették az iskolába, a fehér szülők visszavonták gyermekeiket, és az összes tanár megtagadta a munkát, amíg fekete gyermeket írattak be. Csak egy ember vállalta, hogy Ruby-t tanítja: Barbara Henry, Bostonból, Massachusettsből. Barbara Henry több mint egy éven át úgy tanította a csak Ruby Bridgesből álló osztályt, “mintha egy egész osztályt tanítana”.
Az első napon Ruby és felnőtt kísérői az egész napot az igazgatói irodában töltötték, és a tüntetések okozta káosz miatt csak a második napon mehettek órára. A második napon azonban egy fehér diák megszegte a bojkottot, és belépett az iskolába. Egy 34 éves metodista lelkész, Lloyd Anderson Foreman volt az, aki 5 éves lányát, Pamet kísérte át a feldühödött tömegen, mondván: “Csak azt a kiváltságot szeretném, hogy a lányomat iskolába vihessem. Néhány nappal később más fehér szülők is elkezdték elhozni a gyerekeiket, és a tiltakozások kezdtek alábbhagyni. Minden reggel, amikor Ruby iskolába ment, egy nő megfenyegette, hogy megmérgezi. Emiatt az Eisenhower elnök által küldött amerikai marsallok, akik a Bridges biztonságát felügyelték, megengedték Rubynak, hogy csak az otthonról hozott ételeket fogyassza.
Robert Coles gyermekpszichiáter önként jelentkezett Ruby tanácsadására a Frantzban töltött első évében. Heti rendszerességgel találkoztak Ruby otthonában, és később írtak egy gyerekkönyvet Ruby Bridges története címmel, hogy felhívják a figyelmet Ruby történetére.
Ruby családja szenvedett a döntés miatt, hogy a William Frantz Általános Iskolába küldjék: apja elvesztette a munkáját, az élelmiszerbolt, ahol a család mindig is vásárolt, már nem engedte, hogy vásároljanak, és a nagyszüleit, akik Mississippiben voltak részvényesek, megfosztották a földjüktől. Ruby észrevette, hogy a közösségben sokan mások, feketék és fehérek egyaránt, különböző módon támogatásukról tettek tanúbizonyságot: néhány fehér család a tiltakozás ellenére továbbra is Frantzba küldte gyermekeit, egy szomszédja új munkát biztosított az apjának, a helyi bébiszitterek pedig őt és családtagjait védelmezőnek tekintették, egészen odáig, hogy az iskolai kirándulásokon szövetségi rendőrbírók autója mögött sétáltak.