A NPIP által lefedett betegségek a madárinfluenza (baromfipestis), valamint az S. pullorum (pullorum betegség), S. gallinarum (tyúktífusz), S. enterica var. enteritidis, Mycoplasma gallisepticum (MG, krónikus légúti betegség és fertőző orrmelléküreg-gyulladás pulykáknál), M. synoviae (MS, fertőző szinovitisz) és M. meleagridis (MM, egynapos légmellgyulladás). Ezenkívül az NPIP rendelkezik olyan programokkal, mint az “U.S. Salmonella Monitored” és az “U.S. Sanitation Monitored”, amelyek célja a szalmonella szervezetek előfordulásának csökkentése a keltetőtojásokban, csibékben és fiókákban hatékony és gyakorlati higiéniai eljárásokkal a tenyésztőgazdaságban és a keltetőben.
A baromfi az NPIP meghatározása szerint háziasított szárnyasok, beleértve a csirkéket, pulykákat, struccokat, emukat, rheákat, kasszuárokat, vízimadarakat és vadmadarakat (a galambok és galambok kivételével), amelyeket elsősorban tojás és hús előállítására tenyésztenek. Az NPIP-ben háromféle résztvevő vesz részt: független állományok, keltetők és kereskedők. Az NPIP által tanúsított baromfitermékek a keltetőtojások, a kiscsibék, a naposcsibék és a kismadarak. Az amerikai államok túlnyomó többsége megtiltja bármilyen baromfiszállítmány behozatalát, kivéve a pullorum-tífusztól mentesnek minősített baromfiszállítmányokat. Az ilyen tilalmak lényegében azt jelentik, hogy az államok között szállított baromfinak részt kell vennie az NPIP “U.S. Pullorum-Typhoid Clean” programjában, vagy negatív pullorum-tífusz-tesztet kell végezni, mielőtt elhagyja a saját államát. Tizenöt állam megköveteli, hogy a hozzájuk érkező összes pulykaszállítmány MG-tiszta legyen. Ez a követelmény lényegében azt jelenti, hogy az államok között szállított pulykáknak részt kell venniük az NPIP “U.S. MG Clean” programjában, vagy a szállítás előtt MG-mentesnek kell lenniük.
A legtöbb amerikai kereskedelmi partner, amely baromfit és termékeket importál az Egyesült Államokból, szintén megköveteli az NPIP-ben való részvételt. Akkreditált állatorvosokat lehet felkérni, hogy vizsgálják meg az NPIP-ben részt vevő tenyészállományokat az előírásoknak való megfelelés szempontjából, és állítsanak ki egészségügyi bizonyítványokat. Az APHIS minden tavasszal közzéteszi a tojás- és hústípusú csirkéket és pulykákat kezelő résztvevők jegyzékét, valamint a víziszárnyasokat, kiállítási baromfit, vadmadarakat és laposmellű futómadarakat kezelő résztvevők jegyzékét. Ezek a jegyzékek felsorolják az NPIP-ben részt vevő keltetőket, független állományokat és kereskedőket, az általuk kezelt termékeket és a betegségosztályozásokat, amelyekben részt vesznek.