A bioinformatikában a miRBase egy biológiai adatbázis, amely a mikroRNS-szekvenciák és annotációk archívumaként működik. A 2010 szeptemberi állapot szerint 15 172 mikroRNS-ről tartalmazott információt. Ez a szám 2018 márciusára 38 589-re emelkedett. A miRBase regiszter egy központosított rendszert biztosít a mikroRNS-gének új nevek hozzárendeléséhez.
microRNA database
University of Manchester
Ana Kozomara
Kozomara & al. (2011)
www.mirbase.org
miRBase a Sam Griffiths-Jones által 2003-ban létrehozott mikroRNS-regiszter forrásból nőtt ki.
Az Ana Kozomara és Sam Griffiths-Jones szerint a miRBase-nek öt célja van:
- Konzisztens elnevezési rendszert biztosítani a mikroRNS-ek számára
- Központi gyűjtőhelyet biztosítani az összes ismert mikroRNS-szekvencia számára
- Minden egyes mikroRNS-hez emberi és számítógépen olvasható információt biztosítani. mikroRNS
- Minden mikroRNS-hez elsődleges bizonyítékot szolgáltatni
- A mikroRNS célpont információk összegyűjtése és összekapcsolása
A MiRBase az Alveolata-hoz tartozó különböző fajokhoz tartozó miRNS-eket tartalmazza, Chromalveolata, Metazoa, Mycetozoa, Viridiplantae és Virusok. A Viridiplantae esetében a 21. kiadásban (2014) 73 fajra vonatkozóan állnak rendelkezésre adatok. Ez 4800 egyedi érett miRNS-t és 8480 prekurzor szekvenciát tartalmaz.
A MiRBase jelenlegi verziója a 22. kiadás (2018. március).