A lelőhelyen talált emberi leletek arra utalnak, hogy valamikor a Homo sapiens és a neandervölgyiek is lakták Denisovát. Ez a hely az Altaj-hegységben hihetetlen mennyiségű keveredést mutat mind a sapiens, mind a neandervölgyi példányokkal.
A neandervölgyi nő fosszilis lábujját Adam Siepel, a New York-i Cold Spring Harbor Laboratory munkatársa írta le. Ő és kollégái felfedezték, hogy a lábujjcsontban talált DNS 1-7,1%-a az anatómiailag modern emberé volt. Ez volt a valaha felfedezett legjobban megőrzött neandervölgyi genetikai anyag. A Spanyolországból és Horvátországból származó neandervölgyi maradványokkal való összehasonlítás során kiderült, hogy az altaji nő sokkal több sapiens DNS-t tartalmazott, mint azok.
Ez arra utalhat, hogy az ilyen szintű genetikai keveredés ritka volt, vagy hogy az altáji populációkban nagyobb mértékű volt a keveredés, mint az európai populációkban. Hiszen az altáji populációk jelentősen eltértek az európai populációktól, és nagymértékben keveredtek. Ez azt is jelenti, hogy a Homo sapiens a vártnál jóval korábban vándorolhatott ki Afrikából. Az altáji neandervölgyiek és az európai populációk közötti szakadás 167 000 és 68 000 évvel ezelőtt történt Siepel és Sarah Tishkoff, a Pennsylvaniai Egyetem munkatársa szerint, aki nem vett részt az új tanulmányban. A kettéválások időpontja azt jelzi, hogy a sapiens nem csak nagyon korán elérte Eurázsiát, hanem azt is, hogy ez a genetikai keveredés sokkal tovább tartott, mint korábban feltételezték.
